Det var tidernas första damlandskamp på Bornholm och lockade drygt 1.500 åskådare till stadion i Rönne.
Danmark chockstartade med mål redan i tredje minuten av Julie Rydahl Bukh och i sjätte av Anne Dot Eggers.
Med de snabba målen i ryggen tappade det danska anfallet tempo. I andra halvlek gick man ner på trebackslinje för att få mera press på Tjeckien, men det höll så när på att straffa sig med ett stolpskott av gästerna.
Gabriele Chlumecka reducerade strax före halvtid till 2-1.
Inte förrän under matchens sista fem minuter lyckades Danmark avgöra genom Cathrine Paaske Sörensen och Katrine Pedersen. Det sista målet en praktfull frispark.
Ldb Malmös Nanna Johansen fick finna sig i att inte bli inbytt.
Matchen hade helsvensk domartrio, Eva Ödlund tillsammans med assisterande Anna Nyström och Åsa Olsson.