Efter denna stod det fortfarande 1-1. De båda målen gjordes i andra halvlek.
Lisa Björkvik gav Hammarby ledningen men ganska snabbt därefter kvitterade Emelie Björk för Glanshammar.
– Vi gjorde en mycket bra match mot Linköping i torsdags och det var svårt att ladda om till den här. Det var alldeles tydligt, säger Hammarbys tränare Anders Bengtsson.
– På torsdag har vi en mycket viktig match mot Bälinge.
Glanshammar gjorde så klart en bra match genom att även klara att hålla emot i förlängningen.
I straffsparksläggningen gjordes Glanshammars mål av Lillevi Falke, Caroline Malmstedt och Stina Andersson.
Lisa Mattsson vaktade Hammarbys mål och gjorde ett av straffmålen. Malin Nilsson, Malin Broberg och Jennie Jonsson gjorde de övriga. Hammarbys segersiffror skrivs till 5-4.